这个故事发生在1870年的英国。传闻中海怪出现的消息让人恐慌。除了军舰之外的所有政府都在海上巡逻,却不知道这些军舰是被海怪击沉的。 阿龙纳斯教授(丹·汉伦饰)和他的助手康塞尔成了海难的幸存者,而鱼叉手奈德(柯蒂斯·本顿饰)救了他的命。一群人被诺第留斯号潜艇救起,他们也结识了潜艇的主人尼摩船长。 尼摩船长听到很多关于阿龙纳斯的事,把他当作尊贵的客人。 但是船长暴躁的个性和激进的手段使阿龙纳斯明白,这个地方不应该久留。 尼摩船长向阿龙纳斯展示了他苦心研究多年的研究成果,还带他去神秘的海底世界游泳,但阿龙纳斯脑子里只有一个念头,那就是逃跑。